Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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