Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NME3Q13232 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NME3Q13232 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NME3Q13232 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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NME3Q13232 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NME3Q13232 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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