Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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IFT88Q13099 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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IFT88Q13099 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IFT88Q13099 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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