Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 HNRNPA1P44-201ENST00000503999 879 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC079313.2-201ENST00000550474 564 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL158151.4-201ENST00000600965 507 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 PRKCQ-204ENST00000610727 3077 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RORA-202ENST00000309157 1908 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 PIBF1-208ENST00000617689 2882 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 PIWIL2-204ENST00000521356 3488 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 C1S-205ENST00000406697 3076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 GSTO2-202ENST00000369707 6423 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AGXT2-206ENST00000618015 2181 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 SORCS1-202ENST00000344440 3009 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 SPRY1-202ENST00000394339 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 MAPK10-204ENST00000395157 2665 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 NDUFS5P2-201ENST00000484004 306 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LINC00663-206ENST00000589910 732 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 PALM2-AKAP2-201ENST00000302798 4718 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC009318.1-201ENST00000553105 2380 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 PRKAR2A-AS1-202ENST00000416209 3447 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ABCB4-203ENST00000359206 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 AP4S1-211ENST00000616371 4595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 FBXO36-202ENST00000373652 3120 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
MKRN3Q13064 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms