Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PTP4A2Q12974 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PTP4A2Q12974 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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PTP4A2Q12974 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PTP4A2Q12974 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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PTP4A2Q12974 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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