Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PGGT1BP53609 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PGGT1BP53609 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PGGT1BP53609 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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PGGT1BP53609 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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