Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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