Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms