Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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PTPRCP08575 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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PTPRCP08575 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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