Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXA3O43365 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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