Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLIP2Q9UDT6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms