Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms