Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ALS2Q96Q42 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ALS2Q96Q42 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms