Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD4Q96M96 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD4Q96M96 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms