Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTERF3Q96E29 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms