Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms