Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAN3Q58A45 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAN3Q58A45 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms