Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FSCN1Q16658 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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