Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHBQ15464 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHBQ15464 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SHBQ15464 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHBQ15464 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHBQ15464 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHBQ15464 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHBQ15464 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHBQ15464 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHBQ15464 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHBQ15464 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHBQ15464 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SHBQ15464 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SHBQ15464 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms