Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
R3HDM1Q15032 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
R3HDM1Q15032 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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