Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TFAMQ00059 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms