Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT85P78386 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT85P78386 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT85P78386 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT85P78386 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT85P78386 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT85P78386 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT85P78386 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT85P78386 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT85P78386 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT85P78386 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT85P78386 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT85P78386 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT85P78386 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT85P78386 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT85P78386 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT85P78386 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT85P78386 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT85P78386 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT85P78386 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT85P78386 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT85P78386 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT85P78386 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT85P78386 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT85P78386 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT85P78386 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT85P78386 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT85P78386 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT85P78386 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT85P78386 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT85P78386 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT85P78386 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT85P78386 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT85P78386 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT85P78386 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT85P78386 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT85P78386 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT85P78386 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT85P78386 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT85P78386 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT85P78386 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT85P78386 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT85P78386 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT85P78386 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT85P78386 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms