Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AFDNP55196 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AFDNP55196 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AFDNP55196 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AFDNP55196 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AFDNP55196 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AFDNP55196 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AFDNP55196 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AFDNP55196 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AFDNP55196 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms