Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTGFP29279 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTGFP29279 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTGFP29279 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTGFP29279 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTGFP29279 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTGFP29279 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTGFP29279 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms