Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXB1P14653 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms