Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxa5P09021 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms