Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPA1O75762 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPA1O75762 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms