Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eftud2O08810 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms