Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SHOC2Q9UQ13 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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