Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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FOXQ1Q9C009 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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FOXQ1Q9C009 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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FOXQ1Q9C009 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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FOXQ1Q9C009 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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FOXQ1Q9C009 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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FOXQ1Q9C009 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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FOXQ1Q9C009 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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FOXQ1Q9C009 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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FOXQ1Q9C009 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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FOXQ1Q9C009 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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