Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LRRIQ1Q96JM4 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
LRRIQ1Q96JM4 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms