Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 TPM3-201ENST00000271850 1219 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 OR7G3-201ENST00000305444 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PRH2-202ENST00000396400 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 BZW2-203ENST00000407633 898 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL356432.2-201ENST00000407841 422 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SNORA73.3-201ENST00000410213 189 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPS5P2-201ENST00000415238 640 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PRDX3P1-201ENST00000418695 763 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL031848.1-201ENST00000419034 351 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL121999.1-201ENST00000420156 332 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC008155.1-201ENST00000421078 329 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PROSER3-203ENST00000421853 650 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC009365.1-201ENST00000436379 751 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC006463.1-201ENST00000445929 232 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPL10P1-201ENST00000447844 644 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPSAP64-201ENST00000451820 336 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC004448.4-203ENST00000456537 441 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 DISC1-IT1-201ENST00000456782 762 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP82-208ENST00000496652 1112 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC002428.1-201ENST00000523722 771 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 BANF2-205ENST00000545418 360 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ITFG2-AS1-203ENST00000547794 442 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC078886.1-201ENST00000549144 554 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 BMF-210ENST00000561360 735 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01912-201ENST00000581844 496 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CD209-208ENST00000593821 807 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RFPL3-AS1_1.1-201ENST00000617561 88 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL355480.3-201ENST00000630128 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF345-202ENST00000420450 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms