Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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CCDC142Q17RM4 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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