Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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NDUFA9Q16795 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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NDUFA9Q16795 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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NDUFA9Q16795 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NDUFA9Q16795 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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