Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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