Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NTRK2Q16620 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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