Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CHRNA6Q15825 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CHRNA6Q15825 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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