Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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