Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RPS3AP61247 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms