Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CASQ1P31415 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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CASQ1P31415 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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CASQ1P31415 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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CASQ1P31415 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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CASQ1P31415 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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