Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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