Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP35Q9P2H5 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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