Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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