Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
IMPG1Q17R60 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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