Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
USF2Q15853 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
USF2Q15853 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
USF2Q15853 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USF2Q15853 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
USF2Q15853 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
USF2Q15853 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USF2Q15853 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USF2Q15853 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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