Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TAF1AQ15573 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms