Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms