Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms