Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CDH18Q13634 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms