Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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